影像, 追蹤及量化C. elegans
WormLab是一套用來擷取影片、追蹤及分析C. elegans跟其他蟲類. 它擁有非常簡易的軟體操作介面並且非常強大的特殊運算規則對一隻或是很多隻線蟲進行資料蒐集, 像是Omega彎曲、反向動作及線蟲身體糾纏都能進行分析. 這個運算法則可以實際的分析影片類型包括: .avi, .wmv, and .mp4.
透過簡單又直觀的四個步驟來分析您的線蟲:
使用WormLab系統來擷取影片
擷取一個高品質的影片是準確又快速分析的基礎. 要如何擷取一個高品質的影片呢?一套完整的WormLab系統包含了下列要素:
1) 透過WormLab直接連結攝影機擷取影片
2) 一個照明系統提供穩定又平均的光源到您的DISH上
3) 一個特殊設計的支架,可以調整您所需要的工作距離並穩定攝影機到該位置上.
WormLab特點:
- 透過影片檔同時追蹤多個線蟲
- 追蹤所選的線蟲;或是所有在影片當中的線蟲
- 線蟲產生糾纏及重疊時還能繼續追蹤
- 在高中低倍下都能進行追蹤
- 蠕動延伸行進在進階的線蟲模型當中可被偵測
- 多重假設追蹤結果
- 使用曲度及行進方向來辨別頭尾
- 可以使用線蟲外觀、中點、追蹤及頭尾註記進行觀察分析
- 將分析結果輸出成Microsoft Excel檔
- Wormlab內建的workflow工作表讓資料蒐集更有效率
- 從硬碟當中讀取或是直接透過連結的攝影機直接錄製影片檔
- 支援數百種不同的影片編碼
分析 - 超過10,000種量測來分析您的樣本:
WormLab 將追蹤分析結果呈現為多工圖表模式. 您可以透過Microsoft Excel輸出成不同的工作表,或是剪下貼上到不同的應用當中. 逐楨影片詳細的追蹤分析資料及追蹤分析彙總都有提供.
分析輸出內容包含:
- 逐楨影片線蟲位置 (頭部、中點及尾部)
- 置中線點 (不同解析度, 由您自選)
- 移動速度 (即時及移動平均速度)
- 主體面積
- 主體波長
- 追蹤長度
- 方向
- 主體彎曲角度
- 頭部彎曲角度
- Omega彎曲偵測
- 反向動作偵測