影像, 追踪及量化秀丽线虫
WormLab是一套用来撷取影片、追踪及分析C. elegans跟其他虫类. 它拥有非常简易的软件操作接口并且非常强大的特殊运算规则对一只或是很多只线虫进行资料搜集, 像是Omega弯曲、反向动作及线虫身体纠缠都能进行分析. 这个运算法则可以实际的分析影片类型包括: .avi, .wmv, and .mp4.
透过简单又直观的四个步骤来分析您的线虫:
使用WormLab系统来撷取影片
撷取一个高质量的影片是准确又快速分析的基础. 要如何撷取一个高质量的影片呢?一套完整的WormLab系统包含了下列要素:
1) 透过WormLab直接连结摄影机撷取影片
2) 一个照明系统提供稳定又平均的光源到您的DISH上
3) 一个特殊设计的支架,可以调整您所需要的工作距离并稳定摄影机到该位置上.
WormLab特点:
· 透过影片档同时追踪多个线虫
· 追踪所选的线虫;或是所有在影片当中的线虫
· 线虫产生纠缠及重迭时还能继续追踪
· 在高中低倍下都能进行追踪
· 蠕动延伸行进在进阶的线虫模型当中可被侦测
· 多重假设追踪结果
· 使用曲度及行进方向来辨别头尾
· 可以使用线虫外观、中点、追踪及头尾注记进行观察分析
· 将分析结果输出成Microsoft Excel檔
· Wormlab内建的workflow工作表让资料搜集更有效率
· 从硬盘当中读取或是直接透过连结的摄影机直接录制影片档
· 支持数百种不同的影片编码
分析 - 超过10,000种量测来分析您的样本:
WormLab 将追踪分析结果呈现为多任务图表模式. 您可以透过Microsoft Excel输出成不同的工作表,或是剪下贴上到不同的应用当中. 逐桢影片详细的追踪分析数据及追踪分析汇总都有提供.
分析输出内容包含:
· 逐桢影片线虫位置 (头部、中点及尾部)
· 置中线点 (不同分辨率, 由您自选)
· 移动速度 (实时及移动平均速度)
· 主体面积
· 主体波长
· 追踪长度
· 方向
· 主体弯曲角度
· 头部弯曲角度
· Omega弯曲侦测
· 反向动作侦测